Чтобы Safari вообще никогда не открывал новых окон и все ссылки открывал в табах в Терминале надо написать несложную команду:

defaults write com.apple.Safari TargetedClicksCreateTabs -bool true

Выключить, соответственно, с помощью «-bool false».

Лично я вместо табов пользуюсь Spaces и Expose, но вдруг кому-то пригодится.